В период прорыва обороны в Восточной Пруссии в октябре 1944 г. и в ходе дальнейших боев на территории врага капитан Вайгачев водил группы Ил-2 на уничтожение живой силы и техники немцев (Цинтен, Даркемен, Инстербург, Кёнигсберг, Лохштедт, аэродром Нойтиф на косе Фрише-Нерунг).
Отлично владея техникой пилотирования, правильно совершал маневр группы над целью и точно поражал ее.
За 20 успешных боевых вылетов лично уничтожил до 50 немцев, 10 автомашин, подавил огонь 2 батарей МЗА и батарею полевой артиллерии, создал очаг пожара, сопровождавшийся взрывом большой разрушительной силы.
Из наградного листа: «На задания летает с желанием… Над целью ведет себя смело, спокойно, четко и грамотно передает команды своим ведомым по радио».
Приказом войскам 1 ВА № 8/н от 29.01.1945 г. капитан Вайгачев С.Н. награжден орденом Александра Невского.
Из Наградного листа на Вайгачева С.Н., зам. ком-ра ап, инспектора по технике пилотирования 953 шап:
«… Летает с большим желанием как ведущим групп от 4 до 36 самолетов, так и ведомым в качестве контролера, обучая искусству вождения группы молодых ведомых. Сам тов. Вайгачев отлично водит группы, всегда точно выводит на цель, не имея потерь… Отлично владеет радиосвязью, умело командует группой в воздухе, используя рацию тактически грамотно. Не было ни одного случая, чтобы тов. Вайгачев не связался со станцией наведения, всегда точно выполняя ее команды и передавая ценные разведданные.
В последние 20 вылетов лично уничтожил 5 танков, 4 орудия ПА, 10 ж.д. вагонов, 3 цистерны с горючим, 1 артсклад и до 120 солдат и офицеров противника.
16 февраля 1945 г. 4–5 км сев.-зап. Вормдитт тов. Вайгачев, слушая станцию наведения «Алтай-22» обнаружил артбатарею и прицельно с планирования первой серией точно накрыл ее; на третьем заходе второй серией бомб накрыл ж.д. эшелон, стоящий под выгрузкой и зажег его.
26 марта 1945 г. зап. Бальги артиллерия противника мешала продвижению нашей пехоты; тов. Вайгачев вылетел шестеркой на уничтожение артиллерии. После холостого захода тов. Вайгачев обнаружил на опушке леса батарею. Прицельно с планирования двумя сериями накрыл ее и уничтожил.
За отвагу и мужество, проявленными в боях с немецкими захватчиками, достоин награждения орденом Красного Знамени
Ком-р 953 шап полковник Карбирский. _____ апреля 1945 г.».
Источник: ЦАМО. Ф. 33. Оп. 686196. Д. 1760; Личное дело подполковника Вайгачева С.Н.