С 15 июня 1944 г. в боях за Белоруссию и Прибалтику, при прорыве обороны немцев в Восточной Пруссии 18 гв. иап под командованием полковника Голубова проявил исключительное мужество и отвагу. 1008 боевых вылетов на сопровождение истребителей и бомбардировщиков на поле боя совершили летчики полка, провели 64 воздушных боя, в которых сбили 52 самолета противника; лично командир совершил 28 успешных боевых вылетов и провел два воздушных боя, сбив самолет противника.
В боях за освобождение Белоруссии при выполнении разведывательного полета самолет Голубова был подбит и совершил вынужденную посадку. Анатолий Емельянович получил тяжелые травмы, переломы, сотрясение мозга и ожоги.
После длительного лечения вернулся в полк в начале октября 1944 года и участвовал в октябрьских боях 1944 г. в Восточной Пруссии — летал на сопровождение и штурмовку вражеских объектов в р-ны н.п. Эйдткунен, Шталлупёнен, Будупёнен, Барайшкемен.
С 14.01.1945 г. воевал в должности зам. командира 303 гв. иад.
Из наградного листа: «Постоянно находился на основном КП и руководил боевой работой авиации на поле боя. И здесь показал свое умение и организаторские способности волевого командира».
Дивизия в феврале-марте участвовала в разгроме группировки немцев, окруженной юго-зап. Кёнигсберга, совершая разведывательные и боевые вылеты в р-ны н.п. Хермсдорф, Пиллау, Гросс Хубникен.
Приказом войскам 3 БелФ № 292/н от 24.03.1945 г. гв. подполковник Голубов А.Е. награжден орденом Александра Невского.
Из Боевой характеристики на ком-ра 18 гв. иап гв. подполковника Голубова А.Е.:
«… Все предыдущие характеристики положительные. За время /Великой/ Отечественной войны произвел 340 успешных боевых вылетов и сбил 8 самолетов противника. Как летчик подготовлен отлично.
Вывод: По своему боевому опыту и знаниям достоин выдвижения на должность зам. ком-ра ад.
Ком-р 303 иад генерал-майор авиации Захаров.
Может быть ком-ром иад.
Командующий 1 ВА генерал-полковник авиации Хрюкин. 27 февраля 1945 г.».
Из Справки о боевой работе на ком-ра 18 иап подполковника Голубова А.Е.:
«С момента начала … Восточно-Прусской операции полк ведет интенсивную боевую работу, главным образом по завоеванию господства в воздухе над полем боя, на сопровождение бомбардировочной и штурмовой авиации и прикрытию наземных войск.
Невзирая на то, что данный период времени характеризуется сложными метеорологическими условиями, полком совершено 796 боевых вылетов; в воздушных боях сбито 22 самолета противника.
Начальник 1 отделения ОК 1 ВА гв. майор Мордвинов. 27 февраля 1945 г.».
Из Боевой характеристики на ком-ра 18 гв. иап гв. подполковника Голубова А.Е. за 1944 г.
«… Окончил 9 классов в 1926 г., ВТШЛ – в 1933 г., факультет Командиров полков при Академии им. Жуковского в 1941 г. …
Ком-ром 18 полка работает с ноября 1942 г. Опытный ком-р полка, испытанный в боях с противником. Имеет хорошую тактическую подготовку, что помогает ему правильно оценить тактику врага и принять правильное решение.
Гв. подполковник Голубов свой боевой опыт, свои знания умело передает всему личному составу полка, воспитывает в нем ненависть к врагу и преданность своей Родине. Систематически проявляет заботу о личном составе полка. Много уделят внимания работе своего штаба как органа управления полком. Дает полную инициативу начальнику штаба в своей работе, но вместе с тем требует четкости, оперативности в работе всех служб штаба.
В 1944 г. подполковник Голубов 2 месяца находился в госпитале на излечении после ранения.
За весь период летной работы летал на /самолетах/: По-2, УТ-1, УТ-2, Р-5, И-15, -16, И-153, ЛаГГ-3, Як-1, Як-7, Як-9.
В настоящее время летает на самолете Як-3. Общий налет на всех типах самолетов – 2185 ч. Дисциплинированный, исполнительный, требовательный офицер. Характер /твердый и спокойный/. Обладает исключительной настойчивостью и решительностью. При встрече с противником смело вступает в бой…
Один из лучших ком-ров полков… Полк под руководством Голубова проделал огромную работу по разгрому врага…
Подполковник Голубов отличный летчик; техника пилотирования отличная; в воздухе смел и /решителен/; среди личного состава пользуется заслуженным авторитетом.
Вывод: По своему боевому опыту и знаниям достоин выдвижения на должность зам. ком-ра по летной подготовке иад.
Ком-р 303 иад генерал-майор авиации Захаров. 17 декабря 1944 г.».
Источники: ЦАМО. Ф. 33. Оп. 687572. Д. 920; Личное дело Героя Советского Союза генерал-майора авиации Голубова А.Е.