За годы войны гв. майор Борисенко совершил 182 боевых вылета. Бомбил войска и технику, военные и промышленные объекты противника. Дважды бомбардировал Тильзит, четырежды – Кёнигсберг. С апреля 1943 г. по состоянию здоровья гв. майор Борисенко стал летать командиром С-47, выполнил свыше 300 полетов, перевезя ок. 500 т. груза, чем своевременно обеспечил боевую работу частей дивизии.
Из наградного листа: «В период перебазирований на новые аэродромы гв. майор Борисенко, не считаясь с усталостью, а иногда и с плохими метеоусловиями, делал по 2 вылета в сутки, чем обеспечивал быстрейшую переброску всего необходимого, требуемого для боевой работы. Отличный и добросовестный летчик. Летает днем и ночью в любых условиях…. Дисциплинирован как на земле, так и в воздухе…».
Приказом 18 ВА ВВС КА № 98/н от 28.04.1945 г. гв. майор Борисенко Е.И. награжден орденом Александра Невского.
Источники: ЦАМО. Ф. 33. Оп. 690306. Д. 2108.